Projects

Funded projects

Our research is funded by national programmes. The Turkish title is the official one.

2025
TÜSEB 2025–2026 Ongoing

Automatic Staging of Acute Kidney Injury (AKI) with Deep Learning

Akut Böbrek Hasarı (AKI) Evresinin Derin Öğrenme ile Otomatik Tespiti

Group A Urgent R&D Project

PI: Fatma Tuana Doğu · Team: Hülya Doğan

TÜBİTAK 2025–2026 Ongoing

Optimal Imaging and Novel Deep Learning Approaches for 2D and 3D Cell Segmentation in Microscopic Systems

Mikroskobik Sistemlerde 2B ve 3B Hücre Segmentasyonu için Optimum Görüntüleme Sağlanması ve Yeni Derin Öğrenme Tabanlı Yaklaşımlarının Tasarlanması

3501 – National Young Researchers Career Development Program

PI: Hülya Doğan · Team: Feride Sena Sezen, Ramazan Özgür Doğan

2024
TÜSEB 2024–2025 Completed

Novel Deep Learning Approaches for Automatic Prediction of the Mechanisms of Action of Agents Affecting Smooth Muscle Contractility

Düz Kas Kontraktilitesini Etkileyen Ajanların Etki Mekanizmalarının Otomatik Tahmini için Derin Öğrenme Tabanlı Yeni Yaklaşımların Geliştirilmesi

Group A Urgent R&D Project

PI: Feride Sena Sezen · Team: Hülya Doğan, Z. Kalha, İlyas Ay

2023
KTÜ BAP 2023–2024 Completed

A Dataset and Machine Learning Algorithms for 3D Imaging of Blood Cells in Microscopic Systems

Mikroskobik Sistemlerde Kan Hücrelerinin 3B Görüntülenmesi için Veri Seti Oluşturulması ve Makine Öğrenmesi Algoritmalarının Geliştirilmesi

Scientific Research Project

PI: Hülya Doğan · Team: İlyas Ay, Ramazan Özgür Doğan

TÜBİTAK 2023–2024 Completed

Novel Deep Learning Approaches for Optimally Focused Images and 3D Shape Reconstruction in Microscopic Systems

Mikroskobik Sistemlerde Optimum Odaklı Görüntü ve 3B Şekil Oluşturmak için Yeni Derin Öğrenme Yaklaşımlarının Geliştirilmesi

2219 – International Postdoctoral Research Fellowship Program

PI: Hülya Doğan

TÜBİTAK 2023–2024 Completed

Deep Learning Approaches for Extended Depth of Focus in Light Microscopy

Işıklı Mikroskobik Sistemlerde Odaklama Derinliğinin Artırılması için Derin Öğrenme Tabanlı Yaklaşımların Geliştirilmesi

2209-A – Undergraduate Research Projects

PI: Zeinab Danaei · Team: Hülya Doğan

TÜBİTAK 2023–2024 Completed

Deep Learning-Based Autofocusing in Light Microscopy

Işıklı Mikroskobik Sistemlerde Derin Öğrenmeye Dayalı Otomatik Odaklama

2209-A – Undergraduate Research Projects

PI: Fatma Tuana Doğu · Team: Hülya Doğan