TÜSEB
2025–2026
Sürüyor
Akut Böbrek Hasarı (AKI) Evresinin Derin Öğrenme ile Otomatik Tespiti
A Grubu Acil AR-GE Projesi
Yürütücü: Fatma Tuana Doğu · Ekip: Hülya Doğan
KTÜ · Araştırma Grubu · 2023'ten beri
Laboratuvar tezgâhının sinir ağıyla buluştuğu yer.
Farmakoloji Araştırmalarında İnovatif Yapay Zekâ Uygulamaları
Geleneksel farmakolojiyi hızlandıran yapay zekâ ve veri bilimi yöntemleri geliştiriyoruz: daha net mikroskopi ve 3B hücre görüntülemeden ilaç etkileşimlerine ve etki mekanizması tahminine.
2023KuruluşTrabzon, Türkiye
21Yayın11 dergi makalesi
7Destekli projeTÜBİTAK · TÜSEB · BAP
13ÜyeKTÜ · Trabzon Ü.
6SCI-E makaleWeb of Science dizininde
Misyon
Yapay zekâyla hızlanan farmakoloji
Grubumuz geleneksel farmakoloji yöntemlerini geliştirmek ve hızlandırmak amacıyla yapay zekâ ve veri bilimi alanlarını kullanarak yeni çözümler bulan araştırmalar gerçekleştirmektedir. Bu araştırmalar yapay zekâ, derin öğrenme, veri analitiği, görüntü işleme ve farmakoloji alanlarında uzman kişiler tarafından yürütülmektedir.
Disiplinlerarası
Yapay zekâ mühendisleri ve farmakologlar aynı ekipte; laboratuvardan GPU'ya.
Açık veri setleri
Uzman etiketli mikroskopi ve sinyal veri setleri oluşturup paylaşıyoruz.
Titiz ve etik
Tekrarlanabilir iş akışları, özenli doğrulama ve veri yönetişimi.
Araştırma
Neler üzerinde çalışıyoruz
Mikroskoptan kliniğe uzanan, birbirine bağlı altı yön.
Odaklama Derinliğinin Artırılması
Odak yığınından tek bir net görüntü
Odaktan Şekil ve 3B Mikroskopi
Odaktan 3B yapıyı geri kazanmak
Hücresel Görüntü Analizi
Hücreleri bölütlemek ve sınıflandırmak
İlaç Etkileşimleri ve Yeniden Konumlandırma
İlaçların nasıl etkileştiğini öngörmek
Sinyallerden Etki Mekanizması
Kasılma sinyallerinde ilaç etkisini okumak
Klinik Karar Destek
Laboratuvar modellerinden hasta bakımına
Projeler
Projeler
Destekli projeler
TÜBİTAK, TÜSEB ve KTÜ BAP destekli araştırmalar.
TÜBİTAK
2025–2026
Sürüyor
Mikroskobik Sistemlerde 2B ve 3B Hücre Segmentasyonu için Optimum Görüntüleme Sağlanması ve Yeni Derin Öğrenme Tabanlı Yaklaşımlarının Tasarlanması
3501 – Ulusal Genç Araştırmacı Kariyer Geliştirme Programı
Yürütücü: Hülya Doğan · Ekip: Feride Sena Sezen, Ramazan Özgür Doğan
TÜSEB
2024–2025
Tamamlandı
Düz Kas Kontraktilitesini Etkileyen Ajanların Etki Mekanizmalarının Otomatik Tahmini için Derin Öğrenme Tabanlı Yeni Yaklaşımların Geliştirilmesi
A Grubu Acil AR-GE Projesi
Yürütücü: Feride Sena Sezen · Ekip: Hülya Doğan, Z. Kalha, İlyas Ay
Yayınlar
Tüm yayınlar
Öne çıkan yayınlar
An effective pyramid vision transformer-based extended depth of focus technique for optimally focused microscopic imaging
The Journal of Supercomputing, 82(12), 634
From Handcrafted Focus Measurement Operators to Deep Learning: A Comprehensive Review of Shape from Focus Strategies
Archives of Computational Methods in Engineering
Mechanism of Action of Pharmacological Agents: A New Deep Learning-based Prediction Model Using Smooth Muscle Contractility Signals
The 12th International Conference on Computer Technology Applications (ICCTA 2026) · Vienna, Austria
Swin transformer-based shape-from-focus technique for accurate 3D shape estimation
Optics and Lasers in Engineering, 193, 109108
Açık bilim
Kod & Veri
Kod & veri
Toplulukla paylaştığımız kodlar ve özenle hazırlanmış veri setleri.
Hugging Face · veri seti
Onaylı erişim
PCL-PASI: Multi-Task Multi-Device Psoriasis Dataset
pharmaiktu/pcl-pasi
Farelerde sedef (psoriasis) şiddetinin değerlendirilmesi için çok görevli, çok cihazlı görüntü veri seti: kızarıklık, kalınlık ve pullanma puanları; 11 günlük deneyde üç farklı kamerayla çekildi.
GitHub · depo
contractility-moa
pharmaiktu/contractility-moa
1B düz kas kontraktilite sinyallerini Gramian Angular Field görüntülerine dönüştürüp etki mekanizmasını Swin Transformer ile tahmin eden iki aşamalı çerçeve. Kod, makale kabulünden sonra paylaşılacak.
Hugging Face · veri seti
Onaylı erişim
PharmAI KTU Contractility Signals
pharmaiktu/contractility-signals
Farklı reseptör aracılı etki mekanizmalarına sahip ajanlar altında, izole fare trakea ve mesane düz kasından kaydedilmiş 578 izometrik kontraktilite zaman serisi.
Haberler
Tüm haberler
Son haberler
PVT-EDOF makalemiz The Journal of Supercomputing dergisinde yayımlandı
Piramit görüntü dönüştürücüsüne dayalı odaklama derinliği artırma yöntemimiz, mikroskobik görüntüleri optimum odakta birleştiriyor.
DevamıICCTA 2026 Viyana'da iki bildiri
Düz kas kontraktilite sinyallerinden etki mekanizması tahmini ve nöro-odak füzyon çerçevesi.
DevamıYeni çok odaklı veri setimiz Smart Multimedia 2025 Paris'te sunuldu
Mikroskopide odaklama derinliğinin artırılması için yeni çok odaklı veri seti ve derin öğrenme tabanlı görüntü füzyonu.
DevamıPharmAI'ye katılın
Farmakolojide yapay zekâ ilginizi çekiyor mu? Öğrenciler (bitirme, yüksek lisans, doktora), misafir araştırmacılar ve iş birliği yapmak isteyen laboratuvarlar; kısa bir özgeçmiş ve ilgi alanlarınızla bize e-posta gönderin.